Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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