Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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