Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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