Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LAMA3Q16787 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LAMA3Q16787 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LAMA3Q16787 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LAMA3Q16787 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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LAMA3Q16787 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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LAMA3Q16787 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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