Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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