Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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