Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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