Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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