Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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