Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms