Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms