Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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