Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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