Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms