Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABEP1Q15276 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms