Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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