Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms