Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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