Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM29Q14134 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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