Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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