Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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