Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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