Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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