Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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DNASE1L3Q13609 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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DNASE1L3Q13609 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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DNASE1L3Q13609 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms