Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PMS2P3Q13401 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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