Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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CBX3Q13185 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CBX3Q13185 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX3Q13185 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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