Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXF1Q12946 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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