Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
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