Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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