Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROQ12816 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TROQ12816 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TROQ12816 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TROQ12816 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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