Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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