Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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