Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms