Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms