Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms