Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP3CAQ08209 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms