Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
POLEQ07864 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLEQ07864 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLEQ07864 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms