Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms