Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms