Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms