Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACVR1Q04771 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms