Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms