Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms