Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms