Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms