Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms