Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms