Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CABP4P57796 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CABP4P57796 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms