Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHB3P54753 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms