Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRISP1P54107 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms